Stellenangebot des Universitätsklinikums

Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in (Postdoc) (m/w/d) für „MS-based single-cell and spatial multi-omics“

Stellen-ID
13045
Veröffentlicht am
26.03.2026
Jobtitel
Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in (Postdoc) (m/w/d) für „MS-based single-cell and spatial multi-omics“
Einsatzbereich
Institut für Experimentelle Immunologie und Bildgebung, Abteilung für Immundynamik
Stellenart
Wissenschaftliche Stelle
Stellen-ID
13045
Eintritt
01.06.2026
Umfang
Vollzeit; 38,5 Std.
Vertragsart
Befristet
Befristung
31.08.2027; Projektbefristung gem. §14 Abs. 1 TzBfG
Vergütung
EG 13 TV-L
Ihre Aufgaben
  • Messung und Analyse von Datensätzen aus flüssig chromatographischer Massenspektrometrie (LC-MS/MS) und bildgebender Matrix-assoziierter Laser-Desorptions Ionisierungs Massenspektrometrie MALDI-MSI
  • Etablierung von multiplex IF Mikroskopie-Färbungen und automatisierte Analyse mikroskopischer Datensätze mittels Segmentierungsalgorithmen und KI
  • Isolation von malignem Gewebe / Zellen durch Lasermikrodissektion für weiterführende massenspektrometrische Untersuchungen
  • Anwendung der Lichtblatt-Mikroskopie in Kombination mit der Massenspektrometrie
  • Entwicklung von Methoden zur "minimalen proteischen Probenvorbereitung"
  • Etablierung bioinformatischer Algorithmen zur Registrierung von multi-omics Ansätzen aus massenspektrometrischen- und mikroskopischen Datensätzen
  • Integrative Beurteilung der Daten mittels Multivariate Analysen, Dimensionalitätsreduktion, und "Pathway", "Signaling" und "Erichment" Analysen
  • Etablierung neuer Algorithmen des maschinellen Lernens, um Muster in massenspektrometrischen und mikroskopischen Datensätzen zu identifizieren
  • Unterstützung der Arbeitsgruppe "Single-cell and spatial multi-omics" mit Betreuung von Studenten und PhD-Studenten
Ihr Profil
  • Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master oder Diplom) in Chemie, Physik, Molekularbiologie, Biomedizin, Biologie oder einem vergleichbaren Fachgebiet sowie abgeschlossene Promotion
  • Exzellente Expertise für Massenspektrometrie
  • Sie arbeiten selbständig/eigenverantwortlich und zuverlässig
  • Sie sind flexibel, engagiert und teamfähig
  • Sie besitzen sehr gute EDV- und Englischkenntnisse
Wünschenswerte Kenntnisse und Kenntnisse, die im Rahmen der Arbeit ausgebaut werden sollen:
  • Expertise in der Massenspektrometrie, Bioinformatik, Mikroskopie und Systembiologie
  • Analyse mikroskopischer und massenspektrometrischer Datensätze
  • Integrative Analysen über Systembiologie und Pathway Analysen
  • Algorithmen des maschinellen Lernens
  • Softwares / Sprachen / Anwendungen: MS-Office, Spectronaut, DIA-INN, Proteome Discoverer, R, Python, Cytoscape, SkilsLab, String, GSEA
Freuen Sie sich auf
  • ein hochmotiviertes, internationales Team
  • ein fortschrittliches Wissenschaftsumfeld in der Immundynamik
  • die Anwendung neuester technologischer Herangehensweisen
  • dynamischen wissenschaftlichen Austausch
  • ein hochauflösendes Mikroskopie- und Massenspektrometrie-Portfolio
  • interdisziplinäre und translationale Forschung mit humanen Proben
  • Entwicklung von Therapieansätzen für die zielgerichtete Medizin
  • Einen sicheren Arbeitsplatz im öffentlichen Dienst des Landes NRW
  • Faire Bezahlung nach Tarif (TV-L) inkl. Jahressonderzahlung und betrieblicher Zusatzversorgung
  • 30 Tage Urlaub im Kalenderjahr (bei einer 5-Tage-Woche)
  • Interdisziplinäres Arbeiten mit Kolleginnen und Kollegen aus anderen Fachbereichen
  • Arbeiten mit moderner Ausstattung und zertifizierten Qualitätsstandards
  • Familienfreundliche Unternehmenskultur, z. B. Betriebskindertagesstätte, Ferienprogramm für schulpflichtige Kinder, Beratung und Unterstützung durch die Abteilung für Familie & Gesundheit in allen Lebenslagen
  • Vielfältige Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten, bspw. in der Bildungsakademie des UK Essen
  • Gesundheitsmanagement, z. B. Betriebliches Eingliederungsmanagement, Impfungen, Förderung von Sportangeboten
  • Attraktive Zusatzleistungen, bspw. vergünstigtes Kantinenessen, Gemeinschaftsevents, Wohnheimplätze
Rahmenbedingungen
  • Das UK Essen strebt eine Erhöhung des Frauenanteils in Bereichen an, in denen Frauen unterrepräsentiert sind. Sie werden zur Bewerbung aufgefordert und im Sinne des LGGs bei gleicher Qualifikation vorrangig berücksichtigt.
  • Schwerbehinderte Bewerberinnen / Bewerber und Gleichgestellte i.S. des § 2 Abs. 3 SGB IX werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt.
  • Die ausgeschriebene Stelle ist grundsätzlich auch für Teilzeitbeschäftigte geeignet.
  • Die Eingruppierung richtet sich nach den persönlichen und tariflichen Voraussetzungen.
  • Im Falle einer schriftlichen Bewerbung reichen Sie Ihre Unterlagen nur als unbeglaubigte Kopien ein und verwenden Sie keine Mappen, da keine Rückgabe erfolgt. Eine Vernichtung entlang der datenschutzrechtlichen Bestimmungen wird zugesichert.
  • Eine Bescheinigung gemäß §23a Infektionsschutzgesetz (IfSG) über den Impf- und Serostatus bzgl. Masern ist erforderlich.